將 DNA 重新放入 DNA 甲基化裡

2011年10月29日 星期六
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長期以來, DNA 甲基化模式的由來一直都是個謎。最近的一個研究結果帶來了重大的突破, DNA 本身的序列便是決定此模式的重要因素。

引用 Adrian Bird 的說法,「 Dirk Schubeler 以及他的同事們進行了一個『優美的』實驗,建立了掌管 DNA 序列和甲基化模式之間關係的規則。」

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利用 R 製作台灣地圖

2011年10月15日 星期六
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photo credit: ClipArt ETC
這一篇文章的重點有二:

  • 提供製作台灣地圖的 R 指令以及相關資源
  • 顧慮到色盲人士的視覺效果下,給與色彩配製上的建議、方法


話不多說,R 的指令為:


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將資料視覺化的價值

2011年10月12日 星期三
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Column Five 製作的影片,「將資料視覺化的價值」 ( The Value of Data Visualization ),看起來真是可口啊。(棒極了)



The Value of Data Visualization from Column Five on Vimeo.

筆者非常喜歡影片使用簡約的顏色,富有創意的場景轉換,以及他們試圖傳達的核心概念。

視覺化資料的價值在於有更好的溝通,帶來更棒的創新!

DATA needs DESIGN

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歷年諾貝爾獎獎落何處?讓圖表告訴您

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Photo credit: Wikipedia
自 1901 年起,除了 1940 至 1942 之外 (因為德軍佔領挪威),每年頒發的諾貝爾獎都落入那些國家的手中呢?

美國商業週刊《富比士》喬恩布魯納 ( Jon Bruner ) 製作了一張漂亮清楚的圖表,每個點代表獲取一個獎項。呈現出主要得獎國的獲獎情形,此外還加入了近來年有加速獲獎的日本和中國。
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為什麼富含鳥嘌呤的DNA序列會妨礙轉錄

2011年10月6日 星期四
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人們已知許多的 DNA 序列因為能夠形成特別的結構因此影響轉錄,從而參與了基因表現量的調控甚或是基因體的穩定性。在眾多可能的序列之中,富含鳥嘌呤 (Guanine) 的 DNA 片斷因為在近年於免疫及端粒上的研究,逐漸為人所知,重要性日益增加。而在不同環境條件的測試下研究人員發現了,轉錄機制的阻撓 (transcription blockage) 很可能是由於形成了不尋常的、穩定的 RNA/DNA 混合 (hybrid)。

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剪開細胞多能性的奧祕

2011年10月3日 星期一
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photo credit:Cell
擁有萬能分化性(pluripotency)的細胞,因為具有轉化成其它超過兩百種細胞的能力,被寄予厚望成為未來治療疾病的新方法,可能用來訂做並取代損壞的組織。

就在今年(2011),嘉伯特 (Gabut) 與他的同事們的研究帶來了一則突破性的發展。他們找到了一個能直接調控負責多能性功能的基因(pluripotency genes)的表現 — 新的拼接變形 (splice variant) FOXP1。 

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